Peugeot Boxer II został zaprezentowany po raz pierwszy w 2006 roku. W tym samym roku ruszyła również masowa produkcja we Włoszech oraz Meksyku. Nowy dostawczak Peugeota zyskał jeszcze bardziej opływowy kształt, dzięki czemu udało się obniżyć współczynnik oporu powietrza o kolejne kilka procent (Cx=0,31). Peugeot Boxer II miał łączyć w sobie ładowność i wszechstronność dostawczaka z komfortem samochodu osobowego. Tym samym powiększono gamę dostępnych wersji nadwozia oraz wprowadzono pewne udogodnienia w kabinie kierowcy.
Druga generacja Peugeota Boxera przyniosła zmiany styliczne. Maska została wyraźnie oddzielona od zderzaka, tworząc charakterystyczny próg. Właściciele i entuzjaści tego modelu trafnie zauważyli, że van sprawia wrażenie jakby prężył muskuły. W samym sercu zderzaka znalazła się plastikowa atrapa w kształcie kratki. Z obu stron maska pojazdu została opatulona przez światła w nowym designie. Znacząca zmiana dotknęła również lusterka boczne, w które wbudowano światła kierunkowskazu. Producent oferował je również w wersjach z czujnikiem temperatury zewnętrznej w jednym z lusterek. Z tyłu pojazdu pojawiły się bardziej nowoczesne światła tylne, znajdujące się na tylnych słupkach. Wersja towarowa miała jeszcze większą przestrzeń ładunkową i oferowała 6 wariantów od 8 do 17 m3, a ładowność (4 wersje) wahała się od 1 do 2 ton. Wśród osobowej wersji, obok 8-osobowego kombi, dostępny był także aż 15-osobowy minibus.
Francuski producent samochodów zrezygnował całkowicie z silników benzynowych. Przeprowadzone analizy wykazały, że na jednostki benzynowe w autach dostawczych decyduje się kilkunastokrotnie mniej klientów niż na silniki diesla. Dlatego w europejska wersja pojazdu do dzisiejszego dnia dostępna jest w sprzedaży jedynie z silnikami napędzanymi ropą naftową. W Boxerze drugiej generacji występowały dwa rodzaje skrzyń manualnych – 5-biegowe oraz 6-biegowe, które przekazywały moc prosto do przedniej osi.
Wewnątrz Peugeota Boxera II starano się wprowadzić modyfikacje, które miały go upodobnić w jak największym stopniu do auta osobowego. Oczywiście producent nie zapomniał również o dodaniu kilku kieszeń i schowków, które potęgowały potencjał przestrzenny vana. Nowa wersja została zaprojektowana w taki sposób by umożliwić w niej montaż dodatkowego wyposażenia –klimatyzacji automatycznej, systemu audio z zestawem głośnomówiącym czy nawigacji satelitarnej GPS. Z biegiem lat i rozwojem technologii, stopniowo implementowano kolejne rozwiązania wykorzystywane w osobówkach do aut dostawczych.
W 2014 roku, 8 lat po premierze, przyszła pora na facelifting Peugeot Boxera II. Dla niektórych osób zmiany były tak duże, że nazywają tę wersję trzecią generacją vana. Nie jest to jednak nazewnictwo fachowe, bowiem producent jasno wskazał, że był to jedynie facelift. Główną zmianą było przemodelowanie pasa przedniego, który wpasował się w panujący styl modeli francuskiej marki. To właśnie design miał przekonać do Boxera osoby zainteresowane autem dostawczym. Kolejne zmiany dotyczyły możliwości konfiguracyjnych. Tylna część pojazdu została obniżona o 7 centymetrów dzięki zastosowaniu pneumatycznego zawieszenia. Największy z oferowanych modeli posiada masę całkowitą na poziomie 4 ton, podczas gdy wersja do przewozu ludzi oferuje 8 miejsc siedzących. Pod maską znów znalazły się 2 jednostki wysokoprężne o tych samych pojemnościach do wcześniej. Tym razem jednak, mniejszy silnik występował w 3 wariantach mocy – 110, 130 lub 150 KM. Większa jednostka generuje 180 KM. W odnowionej wersji wprowadzono nowe reflektory w których znalazły się światła do jazdy dziennej w technologii LED. By zapewnić optymalny komfort kierowcom i pasażerom, fotele zostały wymienione na kompletnie nową generację. Z zmian użytkowych należy również wymienić pojemnik na kubek zintegrowany z konsolą oraz uchwyt urządzeń mobilnych i notatników.
